داستان این انیمیشن برمی گرده به سالها قبل از ماجرای انیمیشن کمپانی هیولاها زمانی که مایک و سالیوان با هم نه تنها رفیق نبودن بلکه از هم بدشون میامده و برای اینکه در کمپانی هیولاها استخدام بشن باید واحد های درسی شون رو در دانشگاه هیولاها می گذروندند .
هنگامی که خدمه سفینه فضایی به خانه باز می گردند شاهد انفجاری عظیم می شوند که همه چیز را در هم می ریزد کاپیتان کرک مامور می شود که عامل این خرابی را که گویا یکی از خودی ها است پیدا کند و در حین این کار درگیر ماجراهایی می شود که . . .
کودکی که از یک سیاره بیگانه در حال نابودی به زمین فرستاده شده است توسط والدین جدید زمینی اش بزرگ می شود گرچه زندگی معمولی به عنوان یک خبرنگار دارد اما زمانی می رسد که مجبور می شود از قدرت های خارق العاده ای که نسبت به انسان ها دارد برای مقابله با افراد شرور استفاده کند .
کهنه سرباز ارتش آمریکا و از اعضای سابق ناتو سرهنگ بنیامین فورد به یک کلبه در کوه های آپالاچی برای فراموش کردن خاطرات دردناک جنگ بوسنی می رود اما خبر ندارد سرباز سابق صرب امیل کواک برای گرفتن انتقام از او به خاطر اتفاقاتی که در جنگ بوسنی افتاده بود دارد به سراغش می یاید . . .
نیک مالوی به عنوان تکنسین اورژانس مشغول به کار است یک روز زمانی که نیک به همراه همسرش از سینما به سمت خانه می روند حادثه ای اتفاق می افتد و نیک برای نجات افراد می شتابد با وجود تلاش های نیک یک نفر در آن حادثه می میرد و همین باعث می شود تا نیک وارد یک بازی مرگبار شود که . . .
هزار سال پس از تحولات عظیمی که موجب فرار انسان ها از زمین شده است اکنون یک سیاره دیگر خانه جدید انسان ها شده است ژنرال سایفر ریج به همراه پسرش کیتای طی یک ماموریت به زمین اعزام می شود اما سفینه در میانه راه گرفتار طوفان می شود و آن ها روی زمین سقوط می کنند سایفر در لابه لای سفینه گیر کرده و در حال مردن است و کیتای باید مامور نجات پدرش شود .
