پس از اینکه مارتین که برادر کوچکتر ربکا می باشد اتفاقات عجیبی را تجربه می کند که باعث می شود به سلامت عقل او شک کنند ربکا نیز دچار تجربیات مشابهی می گردد اما . . .
لو دختری است که به دنبال کار می گردد و هر شغلی را قبول می کند وی می پذیرد در خانه ویلیام ترینِر جوان ثروتمندی که به دلیل یک سانحه توانایی راه رفتن را از دست داده به عنوان مددکار مشغول به کار شود لو موفق می شود میل زندگی را به ویلیام بازگرداند با گذشت زمان رابطه ای عاشقانه بین لو و ویلیام شکل می گیرد که . . .
غریبه ای وارد یک روستای کوچک می شود و مدت کوتاهی پس از آن یک بیماری مرموز در تمام منطقه شیوع پیدا می کند یک پلیس وارد این ماجرا می شود که مجبور است برای نجات جان دخترش این معمای پیچیده را حل کند . . .
داستان فیلم یکسال پس از وقایع قسمت نخست که طی آن لاکپشت های نینجا اجازه ندادند ویروس مرگبار توسط شریدر در نیویورک منتشر شود رخ می دهد خبر می رسد شریدر توانسته از از چنگال قانون بگریزد وی پس از فرار از زندان به سراغ یک دانشمند دیوانه به نام استوکمن می رود تا با استفاده از قابلیت های او تعدادی هیولای کله گنده برای پیش برد اهدافش خلق کند . . .
پس از اینکه افسر پلیس بارنز تصمیم گرفت قاتل پسرش را نکشد این بار او وظیفه سرپرستی تیم امنیتی سناتور چارلن روآن را برعهده می گیرد که قول داده روز پاکسازی را از بین ببرد اما . . .
جنگ بزرگی بین ارتش کریپتونسول ها و مردان ایکس رخ می دهد که عامل این اتفاقات ظهور مردی از دل کویری در یکی از سیاره های دور از کهکشان راشیل است که با قدرت مهار نشدنی اش جنگی به پا می کند که به نبرد آخرالزمان معروف است . . .